蛋白芯片技術的研究對象是蛋白質，其原理是對固相載體進行特殊的化學處理，再將已知的蛋白分子產物固定其上（如酶、抗原、抗體、受體、配體、細胞因子等），根據這些生物分子的特性，捕獲能與之特異
性結合的待測物質（存在于血清、血漿、淋巴、間質液、尿液、滲出液、細胞溶解液、分泌液等），經洗滌、純化，再進行確認和生化分析。

可應用于小分子靶點篩選、信號通路篩選、細胞因子檢測、蛋白相互作用、疾病標志物篩選。相關技術有：HuProt 20K人類蛋白質組芯片、MPA細胞膜芯片技術、LUMINEX液相細胞因子芯片、Simoa超靈敏數字芯片。